隐秘之城是极具挑战性的区域，包含多个复杂谜题和机关。该区域的核心难点在于太阳神庙古墓的四镜反射解谜，需要按照特定顺序调整镜面角度才能激活通道。首先将中间平台降下，操作1号镜子左转反射阳光至左侧柱子，随后攀爬至2号镜子平台调整反射方向至通往3号镜子的柱子。返回1号镜子右转反射至通往3号镜子的柱子，中间平台会下降，继续操作3号镜子左转反射阳光至通往1号镜子的柱子。
完成上述步骤后需再次返回1号镜子调整反射方向至通往2号镜子的柱子，随后操作2号镜子将阳光反射至通往4号镜子的柱子。最终在4号镜子平台完成最后一次反射即可激活中央通道。该解谜的关键在于精确控制每面镜子的转向角度与反射路径，任何顺序错误都会导致机关重置。部分玩家在解谜过程中容易忽略中间平台的升降机制，需特别注意平台状态变化与镜子操作的关联性。
隐秘之城的通道区域存在多处需要绳索摆荡的难点，包括双柱绑绳机关。当遇到高度差过大的双柱时，需先利用绳箭固定较低柱子的机关，通过摆动惯性跃至高柱侧面凸起处。水道区域被淹没的石门需从缝隙潜入，注意水下电鳗的突袭时机。猎鹰试炼高塔需采用先下后上策略，在底层转动机关后沿白色标记攀爬至外围平台，用绳箭联动两处机关才能开启上升路径。
科尔奎支线任务后的古墓入口常出现进退两难的情况，需检查是否遗漏了岩壁上的可抓取点。部分岩缝被瀑布水流遮挡，需使用生存本能高亮提示。帕依提提石碑谜题要求先提升方言技能才能解读宝藏提示，独石碑文字会以蓝色高亮显示关键信息。废弃村庄区域的狼穴背包收集点需全灭狼群后才能安全获取，该背包可解锁本区域求生贮藏点的地图标记。
最终挑战集中在库库尔坎神庙区域，此处需结合潜水与攀爬技巧。被水淹没的通道存在间歇性水流机关，需把握水流间隙快速通过。神庙峡谷的连续摆荡需注意悬吊物承重时限，最佳路线是沿右侧岩壁交替使用钩斧。巨蛇之腹区域的杀手机关需利用泥浆伪装接近控制杆，暗杀守卫后即可解除陷阱。所有隐秘之城的古墓挑战完成后，将获得提升资源收集量的专属技能奖励。
