三条主要剧情线的核心差异体现在角色出身、早期任务分支以及部分对话选项上，但整体主线剧情走向基本一致。游戏通过不同的出身背景为玩家提供独特的初始体验，并在后续任务中提供符合角色身份的额外对话选择，但这些选择通常不会对主线产生决定性影响。
流浪者、街头小子和公司员工三种出身决定了游戏开局的叙事风格和早期任务流程。流浪者起始于恶土，与家族帮派有关联；街头小子扎根于夜之城的街头文化；公司员工则涉及企业阴谋与职场背叛。这些背景故事会通过专属任务线展开，例如公司员工需要处理荒坂集团的内部斗争，而街头小子则与神父等本地势力有更多互动。出身差异主要体现在前几小时的游戏内容中，后续主线任务会逐渐收束为统一剧情。
尽管三条线的核心剧情相同，但某些关键结局的达成条件与出身存在潜在关联。例如公司员工更容易触发与荒坂合作的恶魔结局，流浪者则可能更倾向于加入阿德卡多部族的星星结局。这些关联并非强制，玩家仍可通过自由选择决定最终结局，但出身背景会提供更符合角色设定的叙事逻辑。游戏通过对话选项的细微差别强化角色身份认同，例如公司员工在商务谈判中拥有额外说服手段，而街头小子能凭借本地人脉获取信息。
支线任务和角色互动也受到出身影响。朱迪、帕南等关键角色的好感度事件虽对所有出身开放，但某些对话选项仅对特定背景的玩家显示。例如流浪者在与帕南交流时可触发专属对话，加深剧情代入感。部分武器和装备的获取途径会因出身略有不同，但游戏并未在核心玩法上设置硬性限制。
