采集蜂蜜需要准备空玻璃瓶或空桶作为容器，同时建议穿戴防蜂服或盔甲以避免被蜜蜂攻击。蜂巢通常生成于橡树或桦树附近，当周围有花朵时蜂巢出现概率更高。找到蜂巢后，可以通过右键点击使用容器直接采集蜂蜜，但这种方法可能激怒蜜蜂。
安全采集蜂蜜的方法是在蜂巢下方放置营火。营火产生的烟雾会让蜜蜂保持平静，使用容器采集不会引发攻击。营火合成配方为木棍、木炭和任意原木。需要注意采集后及时移除营火，否则蜜蜂可能因惧怕火焰而无法返回蜂巢工作。蜂巢装满蜂蜜时表面会出现明显黄色液体滴落效果，这是最佳采集时机。
使用蜜脾和木板合成蜂箱后，需在周围种植花朵吸引野生蜜蜂入住。当蜜蜂采集足够花蜜返回蜂箱后，蜂蜜产量会逐步积累。使用带有精准采集附魔的工具移动蜂箱时，内部蜜蜂会保留而不会逃逸。若未使用该附魔工具，破坏蜂箱将导致蜜蜂全部逃出并攻击玩家。
自动化采集系统可利用红石装置实现。蜂箱装满蜂蜜时会输出特定强度的红石信号，通过红石比较器连接发射器与漏斗系统，当检测到蜂蜜满仓时自动触发采集。这种装置需要精确布置红石线路与容器对接位置，确保蜂蜜瓶能准确落入储存箱。自动化设计可大幅提升采集效率，但需要较多资源建造。
