植入体是安装在指挥官大脑中的永久性装备，可以自由佩戴和拆除，不会因摘除或角色死亡而消失。它为玩家角色提供多样化的静态属性加成或特殊技能强化，是舰船装配系统的重要延伸。每个角色拥有八个植入体接口，分别对应大脑的顶叶区、颞叶区、额叶区和枕叶区，每个区域有两个接口，植入体只能安装在对应的区域中，玩家可以随时更换而不会损坏植入体。
植入体主要分为原厂植入体和开发定制的植入体。原厂植入体通过游戏内玩法奖励和商店直接产出，由克劳利、科尔森、卡巴拉和紫荆等公司生产。这些植入体拥有基础的属性加成，但其条目随机性较大，常常包含多条不相关的属性，难以进行靶向搭配，且品质大多停留在T1等级，因此通常作为植入体开发的原材料使用。
游戏中的开发定制功能让玩家能更精准地打造符合自身定位的植入体。开发功能位于空间站内，停机坪上方、科研右侧的位置。每次开发需要消耗三个低一级的植入体和一个更高一级的植入体，通过合成来获得属性更集中、品质更好的定制植入体。这是提升角色评分和战斗效能的关键途径。
针对不同的战斗定位，植入体的搭配思路截然不同。对于追求输出的火力型角色，所有位置的植入体都应携带对应武器系统的加成，以增强该系武器的伤害、冷却缩减、射程和暴击。对于承担防御重任的重装角色，顶叶和额叶区推荐选择核心系统强化来增加抗性，颞叶区可选择原厂的护盾容量强化，枕叶区则可选用护盾系统强化来增加护盾总量。
负责护盾投射的后勤角色，顶叶区应选择护盾系统强化来增加投射量，额叶区选择护盾系统强化来缩短投射冷却时间，枕叶区可选择原厂的机动系统强化。而负责能量投射的后勤角色，顶叶区可选原厂的武器伤害强化，颞叶区选择能量系统强化来增加投射量，额叶区则选择能量上限强化。
对于指挥、干扰或侦查等辅助型角色，植入体的选择应侧重于功能性强化。例如在顶叶区可以选择推进系统强化来提升舰船航行速度，以更好地执行战术机动或侦查任务。玩家最多可以保存三套不同的植入体方案，并根据当前驾驶的舰船或面临的作战环境进行快速切换，从而实现一套装配应对多种情况的需求。
