叛乱机制的核心是城市忠诚度系统。当一座城市被占领后，初始忠诚值仅为50（满值100），并受到附近公民压力、占领不满和宜居度等级的三重减益影响。附近公民压力是主要因素，表现为周边敌对文明或自由城市对该城市施加的负面忠诚度影响。若忠诚度归零，城市将独立为自由城市并可能被其他文明吸收。理解这一机制是解决叛乱问题的前提。
游戏将宜居度划分为多个等级：-7时人口停止增长且非食物产出降低60%，每回合增加4点叛军点数；-5至-6时产出降低30%，每回合增加1点叛军点数；而宜居度为正值时才能每回合减少1点叛军点数。这种不对称设计导致一旦城市因战争陷入低宜居度状态，仅靠自然恢复难以逆转叛乱趋势。叛军点数积累会提升叛乱等级，最高级时每回合可能生成4个近战叛军单位。
首要方法是快速占领目标城市周边的敌方城市，通过减少附近公民压力来稳定忠诚度。军事总督的派遣可显著提升忠诚度恢复速度，驻军、纪念碑和宜居度改良也能提供额外加成。避免步步蚕食战术，集中兵力同时攻占多个相邻城市，利用居民压力相互抵消的优势更为有效。若城市远离本土，需优先派遣总督并配合军事单位驻防。
修建剧院、游乐园等提升幸福度的建筑，或通过政策卡调整资源分配，均可增强忠诚度。自由女神像等特定奇观能彻底消除叛乱风险。宗教同化也至关重要，若未主动创立宗教，需避免被敌对宗教渗透，否则需派遣宗教单位洗刷异教影响。市政广场等早期建筑虽能提供忠诚度加成，但需提前规划建造时机。
玩家需综合评估军事行动速度、资源投入与政策调整的优先级。低宜居度状态下叛军点数的高效积累与正宜居度的缓慢恢复形成鲜明对比，因此预防优于补救。通过系统化理解忠诚度机制，结合战略与战术层面的协同干预，可最大限度降低叛乱对帝国扩张的负面影响。
