要前往海底之心，首先需要完成前置任务月浴之渊系列，包括海祇之眼、海祇之尾、海祇之牙和海祇之鳍四个任务，并收集四颗御灵珠。之后返回珊瑚宫与NPC露子对话，接取海祇之心任务。根据指引传送到海祇岛东南方向的传送点，向北飞行至瀑布区域，在半山腰处找到带有蓝色屏障的洞穴入口，交付四颗御灵珠即可解除屏障进入。进入洞穴后需解开鱼形石像谜题，通过调整石像朝向中心点亮法阵，击败出现的敌人后获得任务道具渊之钥，最终与露子对话完成任务。
进入洞穴后，玩家会遇到四个圆形平台，每个平台上设有鲤鱼石像机关。需通过参拜尊像锁定石像，使其单向转动至头部朝向平台中心。每解开一个平台封印，需击败刷新的水元素怪物。最外侧平台需优先参拜尊像再调整石像，且怪物数量较多，建议携带治疗角色应对。全部解谜完成后，中央水池会出现过场动画，调查后可获得渊之钥。注意解谜过程中若出现异常，重新登录游戏可重置机关状态。
荒海区域的海底探索需采用不同方法。首先点亮荒海中央深井周围的四个雷元素方碑解除第一层封印，使用道具留念镜照射井下的小狐狸石像激活机关。随后与墙壁上的三个机关互动打开第二层封印，进入井下空间。通过解谜使水位下降后，沿左侧通道游至尽头可找到通往海底的路径。该区域包含神樱大祓相关机关，需按特定顺序激活才能完全排干积水。
建议队伍中包含火系角色应对水元素怪物，同时携带治疗型角色保障生存。解谜过程中需注意观察环境线索，如石像底座纹路、法阵光效变化等。若遇到机关失效情况，可通过退出游戏重新加载重置进度。完成任务后不仅能获得常规奖励，还可解锁隐藏成就。探索时不要遗漏洞穴右侧的碎石堆，击碎后可获得包含家具图纸的宝箱。
